يقوم هذا القسم بعلاج جميع أمراض الباطنية كأمراض الصدر مثل الالتهاب الرؤى ، وأزمة الصدر ،والبرد ،وأمراض الجهاز الهضمي مثل أمراض المعدة ،والنزلات المعوية ، والإمساك وكذلك أمراض الحميات مثل الملاريا، وأمراض الكلى وأمراض المناعة والروماتزم ،وقسم مناظير للجهاز الهضمي لعمل مناظير المعدة ومناظير القولون وذلك لاكتشاف أمراض المعدة والمريء مثل قرحة المعدة والإثني عشر ودوالي المريء والمعدة وكذلك منظار القولون لاكتشاف أورام القولون والبواسير والتهابات القولون ،على أيدي فريق طبي متميز